Identificación de Tomato brown rugose fruit virus por RT-PCR de una región codificante de la replicasa (RdRP)

Authors:
  • CGClemente De Jesús García-Ávila
    Clemente De Jesús García-Ávila
  • JLJosé Abel López-Buenfil
    José Abel López-Buenfil
  • KAKarina Araujo-Ruiz
    Karina Araujo-Ruiz
  • AQAndrés Quezada-Salinas
    Andrés Quezada-Salinas
  • JCJosé Manuel Cambrón-Crisantos
    José Manuel Cambrón-Crisantos
  • DODaniel Leobardo Ochoa-Martínez
    Daniel Leobardo Ochoa-Martínez
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Abstract
En la actualidad es de importancia estratégica contar con herramientas de diagnóstico rápido y preciso que permitan conocer si el material de interés está infectado con algún virus de importancia cuarentenaria o económica. Por tal motivo, en el presente trabajo se diseñó un par de oligonucleótidos específicos para la detección del ToBRFV por RT-PCR, considerando una región de la secuencia codificante de la RdRP localizada en el ORF1 y la metodología para detectarlo fue estandarizada. Adicionalmente, los amplicones fueron clonados y secuenciados, los productos fueron usados para predecir la relación evolutiva entre ToMMV, ToMV, TMV y ToBRFV por el método Maximum Likelihood. Los resultados indicaron que los oligonucleótidos diseñados en el presenté trabajo permiten la identificación de manera rápida y específica del ToBRFV.