Ali Erdinç Yalin

Objectives: This study examined whether extracts obtained from Ocimum basilicum using ethanol or methanol influence endothelial inflammatory responses and selected miRNAs associated with atherosclerotic processes in an oxidized low-density lipoprotein (oxLDL)-based in vitro model. Methods: Human umbilical vein endothelial cells were exposed to oxLDL and subsequently treated with different concentrations of basil extracts. Messenger RNA levels of vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1) and E-selectin, together with expression of miR-21-5p and miR-31-5p, were quantified by real-time polymerase chain reaction. Corresponding protein concentrations of VCAM-1 and E-selectin were determined using enzyme-linked immunosorbent assay. Results: OxLDL exposure was associated with increased expression of adhesion molecules and miR-31-5p, consistent with an inflammatory endothelial response. Treatment with basil extracts led to reduced E-selectin expression at both transcriptional and protein levels and was accompanied by lower miR-31-5p expression in several treatment conditions. Decreases in VCAM-1 mRNA were observed in selected groups, whereas VCAM-1 protein concentrations did not show significant variation. miR-21-5p expression remained largely unchanged across experimental conditions. Conclusions: Basil extracts influenced molecular changes related to oxLDL-induced endothelial inflammatory activation, particularly through effects on E-selectin expression and miR-31-5p regulation. These observations suggest that phytochemical-rich plant extracts may contribute to modulation of early endothelial alterations linked to vascular inflammatory processes.

Free radicals and nitric oxide play an important role in the pathogenesis of Myoglobinuric Acute Renal Failure (mARF). Herein, we aimed to investigate the effects of Ferula elaeochytris on the oxidative-antioxidant system and nitrosative stress in experimental mARF. In our study, 56 Sprague-Dawley rats, equally divided in seven groups, were used as model organisms of experimentally induced mARF. A disease model of mARF was established with 50% glycerol in all groups except one. Moreover, 40 mg/kg and 80 mg/kg of F. elaeochytris root extract were administered intragastrically before and after model creation. The following were investgated in the kidney tissue: serum urea nitrogen, urea, creatinine, sodium and potassium levels of rats in all groups; urinary urea and creatinine levels; MDA, SOD, GPx, CAT, NO and nitrotyrosine parameters. In addition, histological changes in the kidney were recorder with electron microscopy. Significant changes were observed in the CAT, GPx and MDA values of all groups compared to the control group. Electron microscopy observations also supported these findings. Herein, we provide evidence regarding the limited protective and curative effects of Ferula elaeochytris on mARF through reduction of the oxidant/nitrosative stress.

1. The management of cancer presents a multifaceted challenge, encompassing modalities such as surgery, radiotherapy, and chemotherapy. However, a significant difficulty encountered in clinical onc...

Amaç: Koroner arter hastalığ, koroner arterlerin tıkanmasıyla iskemi oluşması ve sonucunda gerçekleşen hücre ölümlerinin yaygınlığıyla orantılı gelişen komplikasyonlar olarak tanımlanır. Ateroskleroz oluşumunda endotel hücrelerinin disfonksiyonu önemli rol oynamaktadır. Bir transkripsiyon faktörü olan Kruppel benzeri faktör 2’nin endotel biyolojisinde vasküler tonus, migrasyon, proliferasyon, vazoreaktivite ve anjiyogenez gibi önemli biyolojik olayları düzenlediği ortaya konulmuştur. Çalışmamızda Kruppel benzeri faktör 2 protein düzeyleri ve C1239A polimorfizmlerinin koroner arter hastalığıyla ilişkisinin aydınlatılması amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Kardiyoloji Polikliniğinde koroner anjiyografi yapılan 191 birey çalışmaya dahil edildi. Serum açlık kan şekeri, total kolesterol, HDL kolesterol ve trigliserit düzeylerinin ölçümleri AU5800 (Beckman Coulter, Amerika Birleşik Devletleri) otoanalizöründe yapıldı. Serum LDL düzeyleri Friedwald eşitliği kullanılarak hesaplandı. Serum Kruppel benzeri faktör 2 protein düzeyleri sandviç enzim bağlı immünoassay yöntemiyle Multiskan GO (Thermo Scientific, Finlandiya) cihazında çalışıldı. Kruppel benzeri faktör 2 C1239A varyasyonları TaqMan® tek nükleotid polimorfizm (SNP) genotiplendirme yöntemiyle Applied Biyosistem VIIA ™ 7 Real-Time PCR (Life Technologies Co., Amerika Birleşik Devletleri) cihazında saptandı. Bulgular: Erkeklerin kadınlara göre KAH açısından 3,8 kat daha riskli olduğu saptandı (Odd’s Oranı 3,83, %95 Güven Aralığı 1,98-7,39; p<0,001). Kruppel Benzeri Faktör 2 protein düzeylerinin gruplar arasında anlamlı farklılık göstermediği saptandı. Kruppel benzeri faktör 2 C1239A polimorfizmlerinin koroner arter hastalığı için risk teşkil etmediği saptandı. Sonuç: Kruppel benzeri faktör 2 gen polimorfizmlerinin KAH için risk faktörü olup olmadığının ortaya konulması için diğer gen bölgelerini de içeren daha geniş örneklem gruplarıyla yapılacak daha kapsamlı çalışmalara ve meta analiz çalımalarına ihtiyaç duyulduğu düşünülmektedir. Purpose: Coronary artery disease is defined as complications that develop in proportion to the prevalence of ischemia due to occlusion of the coronary arteries and the resulting cell death. The development of atherosclerosis is significantly influenced by endothelial cell dysfunction. Kruppel-like factor 2, a transcription factor, has been shown to regulate critical biological events in endothelial biology, such as vascular tone, migration, proliferation, vasoreactivity, and angiogenesis. In our study, it was aimed to clarify the relationship between coronary artery disease and Kruppel-like factor 2 protein levels and C1239A polymorphisms. Materials and Methods: 191 individuals who underwent coronary angiography at Mersin University Faculty of Medicine, Department of Cardiology, Health, Research and Application Center were included in the study. Measurements of serum fasting blood glucose, HDL cholesterol, total cholesterol, and triglyceride levels were performed on the AU5800 (Beckman Coulter, United States) autoanalyzer. Serum LDL levels were calculated using the Friedwald equation. Serum Kruppel-like factor 2 protein levels were measured by sandwich enzyme-linked immunoassay method on the Multiskan GO (Thermo Scientific, Finland) device. Kruppel-like factor 2 C1239A variations were detected on the Applied Biosystem VIIA™ 7 Real-Time PCR (Life Technologies Co., United States) device by TaqMan® single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping method. Results: Men had a 3.8-fold higher risk of CAD than women. (Odd’s ratio 3.83, 95% Confidence interval 1.98-7.39; p<0.001). Kruppel-Like Factor 2 protein levels were not significantly different amongst the groups. Kruppel-like factor 2 C1239A polymorphisms were not associated with coronary artery disease. Conclusion: More comprehensive studies with larger sample groups including other gene regions and meta-analysis studies are needed to determine the relationship between Kruppel-like factor 2 gene polymorphisms and coronary artery disease.

Purpose: Primary Raynaud’s phenomenon (PRP) is a vascular disorder characterized by recurrent vasospastic response of the fingers and toes to cold or stress. ATP-sensitive potassium (KATP) channels are widely distributed in vasculatures, and play an important role in the vascular tone regulation. The major vascular isoform of KATP channels is composed of Kir6.1/SUR2 (KCNJ8/ABCC9). It would be important to determine whether variations of KATP genes related to PRP is thought to be associated with vasospasm. It is believed that the studies describing mechanisms involved in the pathogenesis of inherited vascular disorders offers the best opportunity for investigation of the early stages of pathogenicity and diagnosis of PRP and associated other diseases. In this study we aim to investigate possible association between genetic variations observed in KATP channel coding genes and vasospasm associated with PRP. Materials and Methods: In our study; the cases with PRP, the relation between the variation in the KCNJ8/ABCC9 genes (S422L/V734I or rs72554071/rs61688134) was examined. 50 subjects who were diagnosed with PRP (patient group) and 50 healthy subjects (control group) were included in the study. Variations were determined using the Tetra-Primer Amplification Refractory Mutation System-Polymerase Chain Reaction (T-ARMS PCR) method. Results: Of the individuals in the patient and control group included in the study, 21 were male and 29 were female. The mean age of the patients was 25.7±3.36 years, and the mean age of the control group was 25.9±3.44 years. No significant relationship was found between PRP disease and genotype and allele distribution of KCNJ8/ABCC9 genes. Conclusion: This study presented the first findings about KCNJ8/ABCC9 gene variations in the Turkish population and may lead to future studies. Studies involving a higher number of cases and more mutations will be able to show whether there is a relationship between KATP channels and PRP and contribute to the elucidation of PRP pathogenesis in terms of genetic factors.

Giriş: Bakır nanopartiküllerinin (CuNP) günümüzde kullanım sıklığındaki artış insanların bu maddeye olan maruziyetin artması ile sonuçlanmaktadır. Curcuma longa L. ve Naringenin kanser türlerinin oluşma riskinin azaltmakta ve insanlarda koruyucu biyolojik etkilere yardımcı olmaktadır. Amaç: Çalışmamızda, bakır nanopartiküller ile oluşturulmuş oksidatif strese karşı kurkumin ve naringeninin olası koruyucu etkileri incelenmiştir. Yöntem: Çalışmamızda 42 rat 6 gruba ayrılmıştır. Gruplardan biri kontrol grubu iken, diğer gruplara farklı dozlarda kurkumin ve naringenin maddeleri ile CuNP uygulanmıştır. Çalışma sonunda karaciğer dokusu izole edildi ve Süperoksit Dismutaz (SOD), Katalaz (KAT) aktiviteleri, Glutatyon (GSH), Malondialdehit (MDA) düzeyleri ve inflamasyon belirteçleri (IL-1α, IL-1β) araştırılmıştır. Bulgular: Elde edilen bulgular sonucunda, bakır nanopartiküllerin oksidatif stresi arttırdığı ve antioksidan enzim seviyelerinde düşüşe sebep olduğu; kurkumin ve naringeninin ise oksidatif stresi azalttığı ve antioksidan enzim seviyelerini arttırdığı saptanmıştır. Karaciğer dokusunda IL-1α parametresi incelendiğinde, kontrol grubu ve farklı dozlarda kurkumin ve naringenin CuNP ile karşılaştırıldığında, IL-1α düzeyinde azalma saptanmıştır. Bu düşüş istatistiksel olarak anlamlı değildi. IL-1β parametresi, kontrol grubuna kıyasla CuNP grubunda istatistiksel olarak anlamlı bir artış gösterdi (p<0.05). IL-1β düzeyi incelendiğinde diğer gruplara kıyasla CuNP grubunda artma saptanmıştır. Sonuç: İnsanların bakır nanopartiküllere maruz kalması durumunda oluşabilecek zararlı etkilerden korunma ve tedavi için kurkumin ve naringenin kullanılabileceği düşünülebilir.

ÖZET Glokom, optik sinirin dejenerasyonu ile karakterize karmaşık bir hastalıktır ve dünya çapında geri döndürülemez körlüğün en yaygın nedenidir. Epidemiyolojik çalışmalar, glokomdan etkilenen ailelerin raporları, genom çapında ilişkilendirme çalışmaları ve glokomun hayvan modelleri kullanılarak glokom için genetik bir temel oluşturulmuştur. Glokom, nadir görülen erken başlangıçlı hastalık (40 yaşından önce) için tipik olan Mendel kalıtımı ve yaygın erişkin başlangıçlı hastalık formlarında belirgin olan karmaşık kalıtım ile her yaşta ortaya çıkabilmektedir. Son çalışmalar, miyosilin, optineurin ve TANK bağlayıcı kinaz 1 mutasyonlarının neden olduğu erken başlangıçlı glokomu olan bazı hastalar için olası terapötik hedefler önermektedir. Erken başlangıçlı glokom hastalığının tanısında kullanılan genetik testler de semptomatik hastalıkların tespiti için yararlı olduğunu kanıtlamaktadır. Primer Açık Açılı Glokom, Primer Açı Kapanması Glokomu ve Eksfoliyasyon Sendromu olmak üzere üç yaygın yetişkin başlangıçlı glokom tipi bulunmaktadır. Tamamlanan genom çapında ilişkilendirme çalışmaları sonucunda; Primer Açık Açılı Glokom’un: ABCA1, AFAP1, GMDS, PMM2, TGFBR3, FNDC3B, ARHGEF12, GAS7, FOXC1, ATXN2, TXNRD2, Primer Açı Kapanması Glokomu’nun: EPDR1, CHAT, GLIS3, FERMT2, DPM2-FAM102 ve Eksfoliyasyon Sendromu Glokomu’nun ise CACNA1A genleriyle ilişkili olduğu belirlenmiştir. Yapılan bu çalışmalar hastalık patogenezine katkıda bulunan önemli biyolojik yolları ve süreçleri tanımlamaya yardımcı olmaktadır.

Amaç: Koroner arter hastalığı (KAH), Amerika Birleşik Devletleri ve diğer gelişmiş ülkelerde ilk ölüm nedeni olan, dünyadaki en yüksek ölüm oranına sahip hastalıklardan biridir. Bireylerin yaşam kalitesinin arttırılması açısından koroner arter hastalığına yatkınlığın olup olmadığının erken zamanda öğrenilebilmesi, önlem alınması veya tedavi şansının oluşturulabilmesi için genetik alt yapısının belirlenmesi önem taşımaktadır. KATP kanalları Kir6 ve SUR alt birimleri KCNJ8 (Kir6.1), KCNJ11 (Kir6.2), ABCC8 (SUR1) ve ABCC9 (SUR2) genleri tarafından kodlanmaktadır. Kir6.1 ve SUR2 proteinlerini içeren ATP bağımlı potasyum kanalları özellikle koroner arterlerde olmak üzere damar tonusu düzenlenmesinde kritik bir öneme sahiptir. Çalışmamızda, risk faktörü olduğu düşünülen KCNJ8 genine ait S422L varyasyonunun koroner arter hastalığıyla ilişkili olup olmadığı araştırılmıştır. Yöntem: Çalışmamıza, koroner anjiyografi ile koroner arterlerinde %50 ve daha fazla darlığı saptanan 100 hasta ve %50 ve daha az darlığı olan 100 birey kontrol grubu olarak çalışmaya dahil edilmiştir. Olgulardan alınan kan örneklerinden S422L polimorfizmi, Tetra-Primer ARMS PCR yöntemi kullanılarak belirlenmiştir. Bulgular: Bu çalışmada S422L varyasyonuyla koroner arter hastalığı arasında anlamlı sayılabilecek bir ilişki tespit edilememiştir. Sonuç: Daha fazla örneklem üzerinden yapılacak çalışmalarla KATP genlerindeki varyasyonların koroner arter hastalığıyla ilişkisinin incelenmesinin genetik açıdan faydalı olacağını düşünmekteyiz.

Meltem Gungor, Ergul Belge Kurutas, Erkan Oner, Velid Unsal, Hatice Altun, Ali Erdinc Yalin, Serap Yalin, Ozlem Bozkus, Nilfer Sahin. Clin Psychopharmacol Neurosci 2021;19:530-6. https://doi.org/10.9758/cpn.2021.19.3.530