O. N. Kuleshova

Pleurobrachia Fleming, 1822 is the native taxon of ctenophores in the Black Sea. Until now, its species affiliation has not been resolved: the Black Sea Pleurobrachia is referred to either P. pileus (O.F. Müller, 1776) or P. rhodopis (Chun, 1879). In the taxonomic reviews, both species are recognised as occurring in the Black Sea. The experts on zooplankton identified the Black Sea Pleurobrachia based solely on its definitive body size, but size cannot be a sufficient diagnostic feature. To clarify the species identity of the Black Sea Pleurobrachia, we carried out a phylogenetic analysis using the nucleotide sequences of the mitochondrial COI and the nuclear 18S rRNA gene fragments. As a result, we have established that the Black Sea Pleurobrachia is P. pileus and its identification as P. rhodopis in the global taxonomic databases is erroneous.

Влияние низкочастотного электромагнитного излучения (НЭМИ) на растения и животных, включая человека, достаточно спорно. Мало известно и о воздействии НЭМИ на гидробионтов. Мы изучили действие прямоугольных импульсов напряжения различной амплитуды, длительности и скважности, пропущенных через морскую воду, на трихоплакса (тип Placozoa) как на возможную тестовую лабораторную модель. В опытах использовали три штамма Placozoa, Trichoplax adhaerens (H1), Trichoplax sp. (H2) и Hoilungia hongkongensis (H13), отобранных на стационарной стадии роста культуры. Для генерации последовательности прямоугольных импульсов заданной длительности и скважности с частотой до 2 кГц применяли аппаратную платформу Arduino Uno. Среднее значение напряжения до 500 мВ регулировали с помощью схемы делителя напряжения. Для доказательства специфичности действия электрических импульсов на потенциалзависимые кальциевые каналы трихоплакса использовали ингибитор активности кальциевых каналов амлодипин. Животных стимулировали электрическим током под стереомикроскопом. Электроды располагали в непосредственной близости от животного. Исследовали сопутствующие изменения поведения и морфологии пластинки трихоплакса. Выделяли стимулирующие и подавляющие воздействия. Наблюдения документировали с помощью фото- и видеосъёмки. Отслеживали траектории движения отдельных особей. Увеличение напряжения на электродах при фиксированной частоте 20 Гц приводило к тому, что животные штамма H2 покидали «зону электродов» в течение нескольких минут при 25 мВ, однако теряли подвижность пропорционально росту напряжения и обездвиживались при 500 мВ. Именно поэтому в дальнейших опытах применяли напряжение 50 мВ. В экспериментах с двумя электродами, находящимися с одной стороны трихоплакса, у животного было больше возможностей перемещаться в разных направлениях, чем в случае расположения электродов по обеим сторонам пластинки. Направление движения использовали как характеристический признак. Отмечено, что трихоплаксы мигрируют в области с низкой плотностью линий электрического поля, которые расположены вдали или за электродами. Животные из старой культуры отличались меньшей чувствительностью к электрическому раздражителю. Штамм H2 был наиболее чувствительным и демонстрировал более выраженные физиологические реакции на частотах 2 Гц и 2 кГц с напряжением 50 мВ, чем штамм H1 и особенно штамм H13. В зависимости от длительности стимулирующих прямоугольных импульсов, их числа, амплитуды и варьирующей частоты менялись двигательные реакции и морфология животных: от направленной или стохастической миграции в сторону анода/катода или от него до обездвиживания животных, увеличения оптической плотности по периферии и в центре пластинки и до сворачивания трихоплакса и отделения его от субстрата. В дополнительных опытах на Trichoplax sp. H2 показано, что при длительности импульсов 35 мс и задержке импульсов от 1 мс до 10 с доля обездвиженных животных увеличивается до 80 % при минимальной задержке. Тем не менее в случае применения амлодипина в концентрации 25 нМ практически все трихоплаксы в течение нескольких минут сохраняли подвижность несмотря на обработку электрическими импульсами. Между тем при использовании амлодипина в концентрации 250 нМ животные двигались дискоординированно и не могли покинуть «электродную...

A wealth of genome and transcriptome data obtained using new generation sequencing (NGS) technologies for whole organisms could not answer many questions in oncology, immunology, physiology, neurobiology, zoology and other fields of science and medicine. Since the cell is the basis for the living of all unicellular and multicellular organisms, it is necessary to study the biological processes at its level. This understanding gave impetus to the development of a new direction – the creation of technologies that allow working with individual cells (single-cell technology). The rapid development of not only instruments, but also various advanced protocols for working with single cells is due to the relevance of these studies in many fields of science and medicine. Studying the features of various stages of ontogenesis, identifying patterns of cell differentiation and subsequent tissue development, conducting genomic and transcriptome analyses in various areas of medicine (especially in demand in immunology and oncology), identifying cell types and states, patterns of biochemical and physiological processes using single cell technologies, allows the comprehensive research to be conducted at a new level. The first RNA-sequencing technologies of individual cell transcriptomes (scRNA-seq) captured no more than one hundred cells at a time, which was insufficient due to the detection of high cell heterogeneity, existence of the minor cell types (which were not detected by morphology) and complex regulatory pathways. The unique techniques for isolating, capturing and sequencing transcripts of tens of thousands of cells at a time are evolving now. However, new technologies have certain differences both at the sample preparation stage and during the bioinformatics analysis. In the paper we consider the most effective methods of multiple parallel scRNA-seq using the example of 10XGenomics, as well as the specifics of such an experiment, further bioinformatics analysis of the data, future outlook and applications of new high-performance technologies.