Alejandro Amaya

The objective of this study was to estimate economic values ( ev ), genetic gains ( gg ), and economic contributions ( ec ) of age at first calving (AFC), calving interval (CI), longevity (LONG), weaning weight (WW), weight at 16 months (W16), and weight at 24 months (W24) within a selection index for the Romosinuano breed. Three production scenarios were evaluated according to the selling age of animals (8, 16, and 24 months). Productive and reproductive parameters were obtained from records provided by AGROSAVIA between 1976 and 2021, while economic information was collected using a structured format designed to characterize production systems. The ev were calculated as the partial derivative of profit per hectare, and ec were derived from gg and ev . Profit per hectare was 239.7, 198.41, and 294.95 USD in scenarios 1, 2, and 3, respectively. CI showed the most relevant ev in scenarios 1 (-0.794 USD) and 3 (-0.979 USD), whereas W16 had the greatest economic value in scenario 2 (1.05 USD). AFC showed negative values across the three scenarios, in contrast to LONG, which presented positive values and considerable ec (0.56, 0.34, and 0.77 USD). Furthermore, WW and AFC were important in scenario 1, while W16 and W24 were relevant in scenarios 2 and 3. In conclusion, CI was confirmed as the trait with the greatest economic impact, whereas W16 and AFC were identified as relevant traits to be included in balanced selection indices. Also, the contribution of LONG highlights the role of Romosinuano cattle in resilient and sustainable Colombian beef production systems.

La estimación precisa del peso vivo (PV) es esencial para decisiones zootécnicas y transacciones comerciales justas; sin embargo, en sistemas de pequeña y mediana escala, el pesaje con báscula se suele ver limitado por costos e infraestructura, lo que favorece el uso de métodos indirectos, como cintas comerciales bovinométricas basadas en el perímetro torácico (PT), cuya validez puede variar según la raza y el biotipo. Este estudio ajustó una ecuación bovinométrica para hembras de ganado criollo Blanco Orejinegro (BON) de Colombia, con el fin de estimar el PV a partir del PT. Se analizaron datos de 59 hembras con medidas morfométricas y dos registros de PV, uno con cinta comercial bovinométrica y otro con báscula. Se estimaron correlaciones de Pearson y se cuantificó el acuerdo mediante sesgo, el error absoluto medio, la raíz del error cuadrático medio y el error porcentual absoluto medio, además de explorar el sesgo proporcional a través de regresión. La relación PT–PV se modeló con una función de potencia en escala logarítmica. El PT mostró las asociaciones más altas con el PV y la cinta métrica comercial presentó evidencia de sobreestimación creciente en animales más grandes. La ecuación local basada en báscula mejoró la precisión, lo que respalda el uso de calibraciones específicas para hembras BON en condiciones de campo.

Background: Genetic improvement programs in domestic species require a set of steps involving the definition of breeding objectives, information systems, variance component estimation, genetic evaluations, selection indexes, and the estimation of genetic progress and variability. Objective: To identify strengths and weaknesses in the design and implementation of genetic improvement programs in Colombian cattle through scientific and academic contributions derived from research. Conclusion: The greatest challenges in the design and implementation of genetic improvement programs in Colombian cattle are currently related to the absence of consensus breeding objectives among farmers and associations. Additionally, there is a need in the short term to improve both the quality and quantity of information available in databases. Finally, conducting economic analyses that consider genetic parameters is essential for optimizing the response to genetic selection, considering the different productive systems and environmental conditions that Colombia offers.

Selection indexes in dual-purpose cattle should include beef, milk and reproductive traits. The principal component analysis is a multivariate technique that allows researchers to explore relationships between explanatory variables and traits of interest. The objective of this study was to construct selection indexes for tropical dual-purpose Simmental cattle based on principal components. The evaluated traits were weight at 8 months of age; age at first calving; cumulative first-lactation milk yield at 60, 150, 210 and 305 days; and first calving interval. The selection indexes were estimated as the sum of the products of the estimated breeding values for the seven traits times their respective eigenvectors for the first three principal components. The three selection indexes from principal components analysis generated favourable expected genetic progress for all the traits. However, a selection index with a high expected genetic progress for all traits could not be obtained. The principal component analysis allows breeders to have a selection index that simultaneously improves milk, beef and reproductive traits in dual-purpose Simmental cattle. Because a selection index yielding high expected genetic progress for all traits could not be achieved, the decision to use a specific selection index will depend on the specific conditions of the market, the local needs and the farmer preference.

Las evaluaciones genéticas convencionales han estado enmarcadas en la estimación de valores genéticos a partir de los sistemas de ecuaciones de modelos mixtos que consideran efectos aleatorios y fijos simultáneamente. En los últimos años, el desarrollo en tecnologías de secuenciación del genoma ha permitido obtener información genómica que puede ser incluida en las evaluaciones genéticas para incrementar las confiabilidades, el progreso genético y disminuir el intervalo generacional. El mejor predictor lineal insesgado en una etapa es una metodología que incluye información genómica reemplazando la matriz de parentesco por una matriz que combina el parentesco por pedigrí y genómico de una población genotipada, permitiendo la estimación de valores genéticos para animales no genotipados. El objetivo de este artículo de revisión fue la descripción de la metodología, sus recientes avances, y conocer algunas de las estrategias que podrían ser llevadas a cabo cuando el número de animales genotipados es bajo.

Objetivo. Estimar parámetros genéticos para peso a los ocho meses de edad (W8M), edad al primer parto (AFC) y primer intervalo entre partos (FCI) usando parentesco genómico y por pedigrí. Materiales y métodos. Se utilizaron 481, 3063 y 1098 registros fenotípicos para W8M, AFC y FCI, respectivamente. La información genómica estuvo compuesta por una población de 718 animales genotipados con un chip que incluyó 30106 marcadores genéticos tipo polimorfismo de nucleótido simple (SNP). Modelos univariado y bivariado fueron construidos bajo la metodología del mejor predictor lineal insesgado convencional (BLUP) y genómico en una etapa (ssGBLUP). Resultados. Las heredabilidades para W8M, AFC y FCI variaron desde 0.25 a 0.26, 0.20 a 0.22 y 0.04 a 0.08, respectivamente. Los modelos de AFC y FCI con la metodología ssGBLUP disminuyeron ligeramente el error y aumentaron la varianza genética aditiva, respectivamente. Conclusiones. La inclusión de información genómica mejora levemente la precisión de las estimaciones genéticas en esta población. Sin embargo, una población de animales genotipados más grande y con mayor conectividad genética por parentesco permitiría aumentar para los criadores el potencial de la metodología ssGBLUP en ganado Simmental de Colombia.

A vital requirement to design and implement a breeding program is to know the structure and genetic diversity of a population. The aim of this study was to characterize population structure and genetic diversity of the Colombian Simmental cattle. The pedigree file included 27,985 animals born from 1975 to 2017. The level of genetic diversity and breed structure was evaluated through probabilities of gene origin expressed via effective number of founders, ancestors and founders genomes. The inbreeding rates and the degree of genetic connectivity were estimated using a regression analysis and a genetic drift variance analysis, respectively. The lowest effective number of founders and ancestors were 50 and 38 by year, respectively. The average inbreeding by year of birth decreased from 5.06% in 1980 to 2.25% in 2017. The dairy line genetic contributions in the overall population increased significantly in the last 37 years, and the beef line contribution decreased. Regarding the genetic connectivity, Colombian regions (administrative divisions) with the largest cattle population had higher values. The results indicate that the availability of European and North American bulls contributes to genetic diversity by increasing the effective number of founders over time in the Colombian Simmental cattle population. However, the intensive use of relatively few founders causes an unbalanced genetic contribution and the loss of genetic diversity by gene pool erosion.

El objetivo de este estudio fue estimar parámetros genéticos con y sin la inclusión deparentesco genómico para la producción de leche acumulada a 60 (PL60), 150 (PL150),210 (PL210) y 305 días (PL305) en ganado Simmental en Colombia. Un total de 2883controles lecheros en 620 vacas de primer parto fueron utilizados. La información genómicase obtuvo a partir de 718 animales genotipados con un chip de una densidadde 30106 marcadores genéticos tipo polimorfismo de nucleótido simple (SNP). Seconstruyeron modelos de tipo univariado y bivariado bajo la metodología del mejorpredictor lineal insesgado (BLUP) y genómico en una etapa (ssGBLUP). Los valores deheredabilidades para PL60, PL150, PL210 y PL305 variaron entre 0,20 a 0,27; 0,25 a052; 0,30 a 0,35 y 0,20 a 0,23; respectivamente. La inclusión de parentesco genómicono aumentó las heredabilidades y tampoco la precisión de las estimaciones para lascaracterísticas asociadas a producción de leche. La escasez de información fenotípica yla baja conectividad genética entre la población genotipada y no genotipada podríanlimitar procesos de selección genética para producción de leche a través del ssGBLUPen la población de ganado Simmental de Colombia.

Cryptosporidium es un parásito zoonótico muy importante en salud animal así como en salud pública. Esto se debe a que el parásito se constituye en una de las principales causas de diarrea en niños, terneros, corderos y una gran variedad de mamíferos jóvenes en una gran cantidad de países. Debido a que la globalización ha permitido el intercambio de material biológico en diferentes regiones alrededor del mundo, se ha favorecido la propagación de enfermedades y se han expuesto a los agentes biológicos a diferentes condiciones ambientales, induciendo así la adaptación a través de cambios genéticos. Con base en el polimorfismo del gen GP60, esta revisión pretende presentar la distribución de Cryptosporidium parvum y Cryptosporidium hominis en humanos y terneros alrededor del mundo. El subtipo que afecta con mayor frecuencia al ganado vacuno corresponde a IIaA15G2R1; en tanto que el subtipo aislado con mayor frecuencia a partir de las muestras humanas es IaA19G2.