Natalie Weiler

Introduction: Shigellosis is an acute infection caused by bacteria of the genus Shigella, with high prevalence in pediatric populations. Surveillance allows the identification of serotypes and resistance patterns, improving clinical and epidemiological management. Objective: To determine the distribution of species, serotypes, and antimicrobial resistance of Shigella spp. in the metropolitan area of Paraguay (2019–2025). Methods: A cross-sectional descriptive observational study was conducted on 610 clinical bacterial isolates received by the Central Public Health Laboratory of the Enteropathogen Network. Species, serotypes, and resistance profiles were identified following standardized protocols. Data were processed in Microsoft Excel® and analyzed using descriptive statistics. Results: Pediatric cases predominated (69.8%). Shigella sonnei (67.2%) and Shigella flexneri (32.8%) were identified. Among 155 strains of S. flexneri, the most frequent serotype was 2a (63.2%). Observed resistance was trimethoprim-sulfamethoxazole 62.6%, ampicillin 39.7%, and azithromycin 13.4%. Intermediate resistance was found to ciprofloxacin 19.4% and azithromycin 21.3%. Conclusions: The study demonstrated the prevalence of S. sonnei and serotype 2a of S. flexneri, along with resistance patterns that compromise commonly used antibiotics. These findings reinforce the need to maintain active laboratory surveillance, update therapeutic guidelines, and strengthen control strategies against resistant strains, with direct impact on public health and clinical management of shigellosis in Paraguay.

Objectives. To describe the whole genome sequencing of double-carbapenemase-producing Enterobacteriaceae isolates circulating in Paraguay. Materials and methods. We conducted genomic studies on seven Enterobacteriaceae isolates, previously confirmed as double-carbapenemase producers by PCR, from patients with extended hospital stays and broad-spectrum antimicrobial treatment in seven hospitals in Paraguay. Genome sequencing included Unicycler assembly and multilocus sequence typing (MLST). Results. Of the seven Enterobacterales isolates producing dual carbapenemases, six were Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae and one was Enterobacter cloacae subsp. cloacae. The co-production of blaKPC-2/blaNDM-1 and blaKPC-2/blaNDM-5 was confirmed in K. pneumoniae. We found co-production of blaNDM-1/blaOXA-163 in E. cloacae, along with other antimicrobial resistance genes of chromosomal and plasmid origin. The MLST sequence types of the K. pneumoniae isolates were ST11, ST15, ST133, ST273, and ST1303, and that of E. cloacae was ST976. Two of the six K. pneumoniae ST11 isolates, from two different hospitals in the capital, were genetically related and both carried blaKPC-2 and blaNDM-5. Conclusions. We report the first genome sequencing of double-carbapenemase-producing Enterobacterales from patients with extended hospital stays in Paraguay. The analysis revealed diverse resistance profiles and clones, carriage of multiple carbapenemases, and other resistance genes of chromosomal and plasmid origin. These findings emphasize the need to strengthen hospital infection control and implement effective therapeutic interventions.

La resistencia a los antimicrobianos (RAM) es una grave amenaza global que compromete la eficacia de los tratamientos contra infecciones, siendo fundamental su detección temprana y el monitoreo continuo de mecanismos emergentes de resistencia. El objetivo de este trabajo fue evaluar la susceptibilidad antimicrobiana de bacterias de importancia clínica aisladas de infecciones nosocomiales y ambulatorias en Paraguay durante el año 2023. Fueron analizados en la Sección Antimicrobianos del Dpto. Bacteriología y Micología del Laboratorio Central de Salud Pública, datos de aislamientos de laboratorios de bacteriología que conforman la Red Nacional de Vigilancia Laboratorial de la RAM en Paraguay, remitidos en formato WHONET. Los resultados revelaron una alta resistencia a los antimicrobianos en aislados de infecciones bacterianas, tanto hospitalarias como comunitarias. Se evidenció un perfil de resistencia alarmante a carbapenémicos (imipenem y meropenem) en Acinetobacter baumannii (83,3% y 78,5%), Pseudomonas aeruginosa (35,1% y 31,2%) y K. pneumoniae (37,4% y 37,9%). En Staphylococcus aureus de origen comunitario y hospitalario, la resistencia a la meticilina fue de 41,8 % y 49,5 respectivamente. La alta resistencia a antimicrobianos encontrada exige un fortalecimiento inmediato de la vigilancia epidemiológica, la implementación de rigurosas medidas de control de infecciones en el ámbito hospitalario y la optimización del uso de antimicrobianos. Un enfoque multisectorial es esencial para abordar de manera global y efectiva esta problemática de salud pública.

La inocuidad de la carne comercializada debe estar garantizada en la cadena de producción, para evitar enfermedades transmitidas por alimentos (ETA). Escherichia coli productor de toxina Shiga (STEC) y Salmonella spp. pueden encontrarse en el tracto gastrointestinal de los bovinos y contaminar la carne de consumo humano, pudiendo causar enfermedades en el hombre. Este trabajo tuvo como objetivo evaluar las condiciones higiénico-sanitarias de 52 carnicerías localizadas en Asunción y detectar la frecuencia de STEC y Salmonella spp. en muestras de carne molida. Las condiciones higiénico-sanitarias se evaluaron mediante la estimación del riesgo, utilizando una escala de clasificación por categorías. La detección de STEC y Salmonella spp. se realizó por PCR en tiempo real. En la evaluación inicial, se clasificaron a 33% de las carnicerías como de alto y moderado riesgo. Se detectó STEC no-O157 en un 50% (130/258) de las muestras y Salmonella spp. en un 11% (29/258). Se realizaron acciones de mejora. En la etapa post-intervención, no se detectaron carnicerías de alto riesgo. En el muestreo de seguimiento se detectó un 29% (66/237) de muestras positivas para STEC no-O157 y 7% (16 /237) para Salmonella spp. Este estudio permitió realizar recomendaciones específicas y detalladas a cada carnicería, lo que tuvo un efecto significativo en la mejora de sus condiciones. Esta situación resalta la importancia de continuar fortaleciendo la vigilancia multisectorial y multidisciplinaria. Es imperativo que los establecimientos que se dedican al rubro, implementen las Buenas Prácticas de Manufactura (BPM) como una medida para reducir los riesgos asociados.

Las bacterias son capaces de desarrollar mecanismos de resistencia a los antimicrobianos, aquellos adquiridos y transmisibles son los más significativos debido al potencial de diseminación. La aparición de Salmonella enterica con resistencia a C3aG, quinolonas y a colistina representa una amenaza progresiva. El objetivo fue determinar la resistencia a los antimicrobianos y la presencia de los mecanismos de resistencia plasmídicos a quinolonas, β-lactámicos y colistina en aislados de Salmonella provenientes de la vigilancia integrada de enteropatógenos. Fueron estudiadas 501 cepas de Salmonella spp. colectadas entre los años 2020 y 2021, por la red de enteropatógenos del Laboratorio Central de Salud Pública. Se investigó la resistencia a las C3aG, quinolonas y colistina, en aislamientos de humanos, alimentos, animales de consumo y ambiente. Las cepas estudiadas exhibieron resistencia a tetraciclina (32,5%), ácido nalidíxico (29%), ampicilina (13,2%), nitrofurantoína (11,6%), C3aG (7,2%), cotrimoxazol (5,8%), ciprofloxacina (2,2%). El 18% (90/501) presentaron resistencia trasferible por plásmidos, fueron detectados 111 genes (71 cepas con un gen, 17 cepas dos genes y 2 cepas tres genes diferentes). Qnr B: 41,1% (37/90), mcr-1: 38,9% (35/90), CMY: 23,3% (21/90), CTX-M: 16,7% (15/90) y Qnr S: 3,3% (3/90). Heidelberg fue el serovar predominante en muestras de pollo y el mayor portador de genes de resistencia de tipo CMY y mcr-1. La detección de genes en alimentos y animales de consumo, que pueden transmitirse fácilmente al ser humano es motivo de alerta y resalta la importancia de continuar fortaleciendo la vigilancia multisectorial y multidisciplinaria.

Introducción: Campylobacter spp., es un agente común de enterocolitis en humanos. Los factores de virulencia que más se han relacionado con patogenicidad son la motilidad por la presencia de flagelos, la capacidad de adherencia e invasión a la célula eucarionte y la producción de citotoxinas. La reposición de líquidos y electrolitos es el tratamiento recomendado, y los antimicrobianos se requieren solo en la enfermedad grave y/o prolongada. Objetivo: Caracterizar los factores de virulencia y la resistencia antimicrobiana en cepas de Campylobacter spp., aislados de pacientes con síndrome diarreico agudo en el Laboratorio Central de Salud Pública, periodo 2020 - 2021. Metodología: El tipo de estudio utilizado fue retrospectivo de corte transversal, tomando como periodo de estudio los años 2020 y 2021, como criterio de inclusión se consideraron todas las cepas aisladas de muestras que se remitieron con la ficha epidemiológica para el estudio de Enfermedades Diarreicas Agudas (EDAS) en el periodo de estudio de 2020-2021. Resultados: Fueron sometidas a estudio unas 168 cepas de Campylobacter spp., donde se observó un predominio de la especie Campylobacter jejuni con un porcentaje de 95% (160/168 ) seguido de Campylobacter coli con un 5 % ( 8/168 ). Se detectaron todos los factores de virulencia investigados siendo el de mayor frecuencia flaA (96%) y ctdC (94%), seguido de cadF (86.9%), ctdB (85%), dnaJ (79.7%), racC (71%) y en menor porcentaje se detectó pldA (49%), ciaB (21%), wlaN (13%) y virB (2%). En cuanto a la resistencia antimicrobiana de las cepas de Campylobacter spp., en este estudio se pudo observar un 51 % de resistencia a ciprofloxacina, 6 % de resistencia a tetraciclina; mientras que para eritromicina se observó una sensibilidad del 100%. Conclusión: La identificación de los factores de virulencia implicados en los procesos infecciosos, así como el conocimiento de la resistencia antimicrobiana del agente etiológico constituyen la clave para mejorar la comprensión de la patogénesis y el desarrollo de terapias para el tratamiento de las infecciones presentadas por este patógeno.

La infección por Clostridioides difficile es una de las principales causas de diarrea nosocomial en hospitales del mundo, asociada a antibióticos de amplio espectro. Estudio descriptivo, retrospectivo, de corte transverso, de tipo censal. Se estudiaron 281 muestras de pacientes hospitalizados con la infección, se analizaron características socio-demográficas, clínicas y se caracterizó molecularmente al patógeno. Como resultado, se obtuvieron pacientes con la infección con una mediana de edad de 64 años siendo el 61,5 % del sexo masculino. El promedio de presentación del cuadro diarreico fue de 5 días, con tratamiento antimicrobiano de 8 días e internación de 15 días. El 94% tuvo tratamiento antimicrobiano previo, y el 6% estuvo expuesto a algún factor de riesgo. Los antimicrobianos más utilizados solos o en combinación fueron betalactámicos, fluoroquinolonas, vancomicina y carbapenémicos. Las áreas de internación con mayor frecuencia de presentación de la infección fueron las unidades de Clínica Médica, Traumatología, Geriatría y Unidad de Terapia Intensiva. La prevalencia de C. difficile toxigénico fue de 14%, y de esta frecuencia el 100% presentó toxinas TcdA y TcdB, con ausencia de toxinas binarias y deleción del gen tcdC. Se constató la presencia grupos clonales en la misma unidad de internación y misma institución de salud. El 100% de las cepas resultaron susceptibles a los antibióticos de elección para la infección. La prevalencia de la infección y presencia de perfiles clonales detectadas revelan la necesidad de un mejoramiento en el sistema de control de infecciones, así como del fortalecimiento y vigilancia de la resistencia antimicrobiana.

La resistencia a los antimicrobianos es una de las preocupaciones más importantes a nivel mundial, ya que determina un aumento de la morbimortalidad de los pacientes y el incremento de los costos de la atención de salud; problema cuyo abordaje debe ser realizado bajo el enfoque de Una Salud. El objetivo principal de este trabajo fue evaluar la resistencia antimicrobiana en Escherichia coli provenientes de muestras cecales de bovinos de carne faenados en frigoríficos de la zona del Arroyo Mburicao, Asunción-Paraguay, de setiembre a noviembre de 2021. Fueron colectadas 181 muestras de ganados provenientes de la Región Oriental y Occidental, y cultivadas en agar cromogénico suplementados con ciprofloxacina, colistina, cefotaxima y meropenem. Las colonias aisladas fueron identificadas, genotipificadas (PCR convencional) y sometidas a pruebas de susceptibilidad. El principal hallazgo fue la confirmación de la resistencia a las fluoroquinolonas en un 8,3% debida a la portación de los genes Qnr S, Qnr B y aac-6´-Ib-cr, involucrados en el mecanismo plasmídico de resistencia a quinolonas. Además, la resistencia acompañante encontrada en los aislamientos resistentes del 100% a tetraciclina y 53% a trimetoprim/sulfametoxazol. No se encontraron aislamientos con resistencia a cefotaxima, colistina y meropenem. Los resultados obtenidos son de suma relevancia para la generacion de conocimiento sobre los perfiles de resistencia de microorganismos en el sector veterinario, pudiendo contribuir a la elaboración de guías nacionales para el uso prudente de antimicrobianos y apoyando al trabajo multisectorial en la lucha para la contención de la resistencia antimicrobiana