GVGabriela Vergara

Gabriela Vergara

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Gabriela Vergara has a total of 21 co-authors. Here are the top co-authors by number of shared publications:


Latest Publications

  • Open Access

    Characterization of Bacterial Diversity in Antarctic Soils Using 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing

    by María Fernanda Pincay Cantos, Juan J. Garrido, Gabriela María Vergara-Grandes, José Miguel Giler-Molina, Angelo Geancarlos Traverso-Pincay

    Antarctic soils harbor highly specialized bacterial communities that perform essential functions in the functioning of polar ecosystems; however, the composition and structure of these communities remain poorly understood in many areas of Antarctica. The objective of this study was to characterize the diversity and structure of bacterial communities present in soils from four islands in the South Shetland Archipelago (Torre, Barrientos, Greenwich, and Dee) using 16S rRNA gene amplicon sequencing. Total genomic DNA was extracted from composite soil samples, followed by amplification of the 16S rRNA gene and sequencing on the Illumina MiSeq platform. Taxonomic classification allowed the sequences to be assigned from the domain level down to the species level, achieving classification rates between 98.47% and 99.39% at the domain level and between 57.39% and 65.88% at the species level. The bacterial communities were dominated by the phyla Bacillota, Pseudomonadota, Actinomycetota, and Bacteroidota, although variations in relative abundance patterns were observed among the composite samples analyzed. Alpha diversity indices revealed high taxonomic complexity, with greater species richness on Dee Island and greater evenness in Greenwich, highlighting differences in the diversity patterns observed among the composite samples analyzed. Taken together, these results expand our understanding of bacterial biodiversity in Antarctic soils and provide a baseline for future research in microbial ecology, biogeography, and the exploration of the biotechnological potential of microorganisms adapted to extreme environments.

  • Open Access

    Descripción morfológica del primer estadio larval de Uca (Petruca) panamensis Stimpson, 1859 (Brachyura: Ocypodidae)

    by John Alex Ramos Veliz, Jordy Armando Soledispa Macías, Grace Cáceres Lucio, Gabriela Vergara Grandes

    Uca (Petruca) panamensis (Stimpson, 1859) es un cangrejo violinista característico de ambientes rocosos del Pacífico Oriental Tropical, cuya morfología larval era desconocida. El presente estudio describe por primera vez la Zoea I de la especie y compara sus caracteres morfológicos con los reportados para especies de los géneros Minuca y Leptuca. La descripción se realizó a partir de 16 larvas obtenidas de una hembra grávida mantenida en condiciones controladas. La larva presentó un caparazón globoso con dos setas dorsales, ornamentación posterolateral faveolada, una espina rostral aproximadamente dos veces más larga que la espina dorsal y un telson sin espinas externas. La comparación morfológica evidenció numerosas similitudes con especies de Minuca y Leptuca, especialmente en las piezas bucales, aunque se observaron diferencias en las fórmulas setales de los maxilípedos. Los resultados aportan caracteres diagnósticos para la identificación de P. panamensis en muestras de zooplancton y sugieren una marcada conservación de los rasgos larvales dentro de la familia Ocypodidae.

  • Open Access

    Metagenomic Insights into the Adaptations of Antarctic Microorganisms to Extreme Environments

    by María Ferannda Pincay Cantos, Juan J. Garrido, Gabriela María Vergara-Grandes, José Miguel Giler-Molina, Angelo Geancarlos Traverso-Pincay

    Metagenomic analysis of Antarctic soils provides a key perspective on the microbial diversity of one of the most extreme ecosystems on Earth, where microorganisms dominate ecological processes, although their diversity and distribution remain less understood than those of macroscopic eukaryotes. This study aimed to identify bacteria present in Antarctic soils using a metagenomic approach. Soil samples were obtained from the sample bank of the Escuela Superior Politécnica Agropecuaria de Manabí and were collected during an expedition conducted in 2014 on four islands: Greenwich, Dee, Barrientos, and Torre. The analysis included DNA extraction, amplification of the 16S rRNA gene by polymerase chain reaction (PCR) using specific primers, and sequencing on the Illumina MiSeq platform (Macrogen©). These techniques enabled reliable identification of the microbial populations present. The results revealed the predominance of several bacterial phyla across all four islands, with Actinomycetales (36.60%), Proteobacteria (20.03%), Firmicutes (17.53%), and Bacteroidetes (6.91%) being the most abundant. In addition, Antarctic soil metagenomes indicated the potential access to novel genes encoding enzymes with possible biotechnological and industrial applications. Overall, these findings highlight Antarctic ecosystems as reservoirs of valuable genetic resources and underscore their importance for the long-term development of biotechnological applications, without extrapolating conclusions beyond the results obtained.

  • Open Access

    AI-Based Virtual Assistant for Solar Radiation Prediction and Improvement of Sustainable Energy Systems

    by Tomás Gavilánez, Néstor Zamora, Josué Navarrete, Nino Vega, Gabriela Vergara

    Advances in machine learning have improved the ability to predict critical environmental conditions, including solar radiation levels that, while essential for life, can pose serious risks to human health. In Ecuador, due to its geographical location and altitude, UV radiation reaches extreme levels. This study presents the development of a chatbot system driven by a hybrid artificial intelligence model, combining Random Forest, CatBoost, Gradient Boosting, and a 1D Convolutional Neural Network. The model was trained with meteorological data, optimized using hyperparameters (iterations: 500–1500, depth: 4–8, learning rate: 0.01–0.3), and evaluated through MAE, MSE, R2, and F1-Score. The hybrid model achieved superior accuracy (MAE = 13.77 W/m2, MSE = 849.96, R2 = 0.98), outperforming traditional methods. A 15% error margin was observed without significantly affecting classification. The chatbot, implemented via Telegram and hosted on Heroku, provided real-time personalized alerts, demonstrating an effective, accessible, and scalable solution for health safety and environmental awareness. Furthermore, it facilitates decision-making in the efficient generation of renewable energy and supports a more sustainable energy transition. It offers a tool that strengthens the relationship between artificial intelligence and sustainability by providing a practical instrument for integrating clean energy and mitigating climate change.

  • Open Access

    Descripción de la primera zoea del cangrejo violinista Uca ornata (Smith, 1870) (Decapoda, Ocypodidae)

    by John Alex Ramos Veliz, Gabriela Vergara

    Los cangrejos violinistas son los braquiuros más representativos en los estuarios, están dentro de la familia Ocypodidae donde los machos presentan un fuerte dimorfi smo sexual por un proceso llamado heteroquelación, también tienen una gran capacidad adaptiva desde su etapa larval, por lo que son necesarios estudios que abarquen parte del desarrollo de estos organismos, Uca ornata (Smith, 1870) es un cangrejo que tiene pocos estudios ecológicos y taxonómicos y la descripción larval es un primer paso, para esto se analizaron larvas de U. ornata obtenidas en cautiverio, donde se realizaron esquemas sobre el primer estadio larval, incluyendo una descripción de las características taxonómicas relevantes con ayuda de microscopía óptica y cámara para microscopio. Los resultados se compararon con otras especies de cangrejos violinistas del mismo género encontrándose que dichas características permiten diferenciar a estas especies aunque sean de áreas geográficas distintas.

  • Open Access

    PRIMER REGISTRO DE MINUCA BREVIFRONS (STIMPSON, 1860) (DECAPODA: OCYPODIDAE) EN ECUADOR

    by John Ramos-Veliz, Gabriela Veragara-Grandes, Jorge Peñaherrera

    La ocurrencia del cangrejo violinista, Minuca brevifrons Stimpson, 1860, en Ecuador (Cantón Eloy Alfaro, Provincia de Manabí) es reportada por primera vez. Los organismos comparten hábitat en un área de manglar destinado a la captura del cangrejo azul, Cardisoma crassum Smith, 1870, donde establecen una relación de inquilinismo, ya que, algunos pueden llegar a habitar en madrigueras construidas por el cangrejo azul. La identificación de especímenes se basó en caracteres taxonómicos y revisión bibliográfica, donde la estructura morfológica distintiva es la anchura de su frente y la cresta oblicua en la palma de la quela mayor. El presente registro extiende su distribución en el lado del Pacífico hasta Ecuador, contribuyendo al conocimiento de la biodiversidad a nivel regional. Se recomienda incrementar los estudios destinados al conocimiento de la diversidad de crustáceos a nivel local con la finalidad de entender su biología, dinámica e interacciones.


  • Estructura poblacional del zooplancton gelatinoso en el mar ecuatoriano

    by Paulina Castillo, Gabriela Vergara, Jaqueline Cajas

    El presente estudio analiza la composición y distribución del zooplancton gelatinoso en el mar ecuatoriano desde Julio 2017 hasta Abril 2018. Se dividió el perfil costero en dos zonas: la ZI abarcó la provincia de Esmeraldas hasta la parte norte de la provincia de Manabí; mientras que, la ZII estuvo comprendida desde la parte sur de la provincia de Manabí y hasta el norte de la provincia de Santa Elena. Se identificó un total de 54 especies, donde las más representativas fueron Doliolum gegenbauri, Doliolum nationalis, Abylopsis tetragona, Cyclosalpa pinnata, Aglaura hemistoma y Rhopalomena velatum; otros grupos con poca representación fueron Copelata, Leptothecata, Narcomedusae, Anthoathecata, Coronatae, Semaeostomeae y Beroida. En cuanto a la distribución espacial, se determinó que la zona con mayor densidad fue la ZII; sin embargo, no se encontraron diferencias significativas a nivel espacial (p = 0.3316). Tanto ZI como ZII presentaron una riqueza específica de 48 especies, aunque se encontraron especies exclusivas para cada zona. Debido a la frecuencia y distribución de las especies encontradas, se considera que son características del mar ecuatoriano y que los órdenes Doliolida y Siphonophorae son los más importantes dentro del zooplancton gelatinoso por su número de especies y densidad. La densidad mostró una baja correlación con la temperatura y salinidad, lo que indica que las poblaciones de zooplancton gelatinoso podrían estar influenciadas por variables bióticas.


  • Open Access

    Distribution of the invasive calanoid copepod Pseudodiaptomus marinus (Sato, 1913) in the Belgian part of the North Sea

    by Yana Deschutter, Gabriela Vergara, Jonas Mortelmans, Klaas Deneudt, Karel De Schamphelaere, Marleen De Troch