Merve Özmen

The recent increase in the number of rare yeasts isolated from clinical specimens is a cause for concern, requiring accurate identification of these yeasts and assessment of their antifungal susceptibility to guide treatment. In this regard, we identified 196 rare yeasts isolated from various clinical specimens, mostly urine and respiratory tract specimens of patients hospitalized in intensive care unit and wards, using MALDI-TOF MS, and assessed their susceptibility to amphotericin B, fluconazole, voriconazole, posaconazole, itraconazole, isavuconazole and anidulafungin using the EUCAST broth microdilution method. Among the rare yeast species we isolated, Candida lusitaniae (13.8%) was the most common, followed by Magnusiomyces capitatus (13.3%), Candida fabianii (12.2%), and Trichosporon asahii (11.7%). Antifungal susceptibility testing revealed high echinocandin MIC values against Magnusiomyces spp., Trichosporon spp., and Rhodotorula mucilaginosa isolates. Similarly, we found high MIC values for fluconazole against the isolates of Magnusiomyces spp., T. asahii, R. mucilaginosa, and several Candida spp., including Candida guilliermondii, Candida pararugosa, Candida rugosa, Candida pelliculosa, Candida norvegensis, and Candida fabianii. We found similar MIC values across phylogenetically closely related species. In conclusion, prompt identification of rare yeasts and assessment of their antifungal susceptibilities are essential for effective treatment of the infections they cause.

İdrar yolu enfeksiyonları, dünyada ve ülkemizde tüm yaş gruplarında karşımıza en sık çıkan enfeksiyonlardır. Kültür sonuçlarının çıkması 24 saati geçmesi nedeniyle, komplikasyon riskini azaltmak amacı ile ampirik tedavi tercih edilmektedir. Ampirik tedavi kullanımı antimikrobiyal ilaçların uygunsuz ve sık kullanımına neden olması, bölgenin antimikrobiyal direncinin bilinmesini gerekli kılmaktadır. Bu çalışmada İstanbul Medeniyet Üniversitesi Göztepe Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda izole edilen üriner sistem enfeksiyonu etkenlerinin incelenmesi ve bu etkenlerin antibiyotik duyarlılıklarının retrospektif olarak belirlenmesi amaçlanmıştır. Hastanemiz laboratuvarına 01 Ocak 2017 – 31 Aralık 2021 tarihleri arasında idrar yolu enfeksiyonu şüphesiyle gönderilen örnekler çalışmaya dahil edilmiştir. Örnekler rutin mikrobiyolojik standartlara göre laboratuvarda işlenmiş, mikroorganizmaların tanımlama ve antibiyotik duyarlılıkları otomatize sistemlerde yapılmıştır. Çalışma süresince laboratuvara gönderilen 154725 idrar örneğinden 35460’ında (%22.9) üreme olmuş, 21671’i (%14.0) anlamlı olarak değerlendirilmiştir. Bakteri üreyen (n=23324) numunelerin %57.6’sında Escherichia coli üremiştir. İkinci sıklıkla %14.6 ile Klebsiella pneumoniae ve üçüncü sıklıkta %9.4 ile Enterococcus faecalis gözlenmiştir. İdrar kültürlerinden en sık izole edilen mikroorganizmalar olan E. coli en yüksek oranda poliklinik hastalarında (%61.8), K. pneumoniae yoğun bakım hastalarında (%21.2) ve E. faecalis ise servis hastalarında (%14.2) gözlenmiştir. İki önemli nonfermenter patojen olan Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii ise beklendiği gibi yoğun bakım ünitesi hastalarında (%12.8 ve %7.0) daha sık gözlenmiştir. E. coli’nin en dirençli olduğu antibiyotik ampisilin (poliklinik için %63.0, servis için %74.3 ve yoğun bakım ünitesi için %76.0), K. pneumaniae’nın en dirençli olduğu antibiyotikler sefazolin(poliklinik için %61.9, servis için 84.0 ve yoğun bakım ünitesi için 90.0) ve sefepim(poliklinik için %45.1, servis için %71.8 ve yoğun bakım ünitesi için %80.4) olarak tespit edilmiştir. P. aeruginosa’nın en dirençli olduğu antibiyotikler sırasıyla poliklinik ve servis hastalarında levofloksasin (%34.3,%28.4), yoğun bakım ünitesi hastalarında piperasilin/tazobaktamdır (%39.0). A. baumannii suşlarının poliklinik ve servis hastalarında en dirençli olduğu antibiyotik seftazidim (%41.1, %78.0) olarak bulunmuştur. Yoğun bakım ünitesi hastalarından izole edilen P.aeruginosa ve A. baumannii izolatlarında sırasıyla imipenem (A. baumannii için %100), piperasilin/tazobaktam (%39.0, %100) ve seftazidime (%19.0, %100) karşı yüksek direnç oranları saptanmıştır. Ayaktan ve yatan hastaların direnç profillerinin farklı olduğunun saptanması, hastane bazında direnç oranlarının bilinmesi kadar bölüm bazında da direnç oranlarının bilinmesinin önemini ortaya koymaktadır. Çalışmamız E. coli ve K. pneumoniae'nın idrar yolu enfeksiyonlarından izole edilen en yaygın patojenler olarak yerlerini koruduğunu ve yaygın olarak kullanılan antibiyotiklere direnç oranlarının yüksek olduğunu ortaya koymuştur.