Irina Medakina
Research Subjects
Irina Medakina has a total of 9 co-authors. Here are the top co-authors by number of shared publications:
- Dmitriy S. Bordin
Department of Pancreatic, Biliary and Upper Digestive Tract Disorders, A. S. Loginov Moscow Clinical Scientific Center, 111123 Moscow, Russia
2 shared publications - Larisa Tsapkova
AS Loginov Moscow Clinical Scientific Center, 1 Novogireevskaya ul., Moscow, Russian Federation, 111123
2 shared publications - Natalia A. Bodunova
Loginov Moscow Clinical Scientific Center, 111123 Moscow, Russia
2 shared publications - Natalya N. Dekhnich
Smolensk State Medical University
2 shared publications - Vera Polyakova
The Loginov Moscow Clinical Scientific Center, 111123 Moscow, Russia
2 shared publications - A.P. Repyev1 shared publication
Latest Publications
- Open Access
- 29 May 2023
- Published by MDPI AG in International Journal of Molecular Sciences
- Vol. 24 (11) , 9433
Helicobacter pylori Antibiotic Resistance: Molecular Basis and Diagnostic Methods
Helicobacter pylori is one of the most common cause of human infections. Infected patients develop chronic active gastritis in all cases, which can lead to peptic ulcer, atrophic gastritis, gastric cancer and gastric MALT-lymphoma. The prevalence of H. pylori infection in the population has regional characteristics and can reach 80%. Constantly increasing antibiotic resistance of H. pylori is a major cause of treatment failure and a major problem. According to the VI Maastricht Consensus, two main strategies for choosing eradication therapy are recommended: individualized based on evaluating sensitivity to antibacterial drugs (phenotypic or molecular genetic method) prior to their appointment, and empirical, which takes into account data on local H. pylori resistance to clarithromycin and monitoring effectiveness schemes in the region. Therefore, the determination of H. pylori resistance to antibiotics, especially clarithromycin, prior to choosing therapeutic strategy is extremely important for the implementation of these treatment regimens.
- 29 May 2023
- Published by MDPI AG in International Journal of Molecular Sciences
- Vol. 24 (11) , 9433
Open AccessHelicobacter pylori Antibiotic Resistance: Molecular Basis and Diagnostic Methods
Helicobacter pylori is one of the most common cause of human infections. Infected patients develop chronic active gastritis in all cases, which can lead to peptic ulcer, atrophic gastritis, gastric cancer and gastric MALT-lymphoma. The prevalence of H. pylori infection in the population has regional characteristics and can reach 80%. Constantly increasing antibiotic resistance of H. pylori is a major cause of treatment failure and a major problem. According to the VI Maastricht Consensus, two main strategies for choosing eradication therapy are recommended: individualized based on evaluating sensitivity to antibacterial drugs (phenotypic or molecular genetic method) prior to their appointment, and empirical, which takes into account data on local H. pylori resistance to clarithromycin and monitoring effectiveness schemes in the region. Therefore, the determination of H. pylori resistance to antibiotics, especially clarithromycin, prior to choosing therapeutic strategy is extremely important for the implementation of these treatment regimens.
- 1 January 2023
- Published by Media Sphere Publishing Group in Russian Journal of Evidence-Based Gastroenterology
- Vol. 12 (3)
A comparative study of laboratory methods for detecting Helicobacter pylori antibiotic resistance
В результате формирования устойчивости H. pylori к антибиотикам снизилась эффективность эрадикационной терапии. Выбор схем эрадикации базируется на данных о локальной резистентности к антибиотикам, прежде всего к кларитромицину. Предложен индивидуализированный подход эрадикации H. pylori, на основе определения устойчивости к антибиотикам до назначения терапии первой линии. ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ Провести сравнительную характеристику фенотипического и молекулярно-генетических методов выявления антибиотикорезистентности H. pylori, оценить их диагностическую чувствительность и специфичность. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ В исследование были включены 25 чистых культур H. pylori с установленной фенотипической чувствительностью и устойчивостью к антибактериальным препаратам. Устойчивость к кларитромицину и левофлоксацину определяли путем серийных разведений в катион-сбалансированном агаре Мюллера—Хинтон с добавлением овечьей крови в соответствии с рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов США (CLSI). Молекулярные маркеры устойчивости оценивали с помощью секвенирования по Сэнгеру и полимеразной цепной реакции в реальном времени (RT-PCR) со специфичными праймерами. Диагностическую чувствительность и специфичность молекулярных методов определяли в сравнении с результатами фенотипического метода. РЕЗУЛЬТАТЫ Установлено полное соответствие результатов фенотипических и молекулярных методов выявления устойчивости H. pylori к кларитромицину. При оценке резистентности к левофлоксацину было показано, что культуры, демонстрирующие фенотипическую устойчивость, также содержали мутации в гене gyrA, связанном с устойчивостью. Вместе с тем, некоторые культуры без фенотипической устойчивости имели характерные мутации гена gyrA. Чувствительность и специфичность молекулярных методов определения резистентности к кларитромицину составила 100%. Чувствительность выявления устойчивости к левофлоксацину составила 100%, специфичность — 78,57%. ВЫВОДЫ Исследование демонстрирует сильную связь между фенотипической и молекулярной резистентностью H. pylori, особенно к кларитромицину. Секвенирование по Сэнгеру и RT-PCR дали стабильные результаты, что подчеркивает надежность данного метода.
- 1 January 2023
- Published by Media Sphere Publishing Group in Russian Journal of Evidence-Based Gastroenterology
- Vol. 12 (3)
A comparative study of laboratory methods for detecting Helicobacter pylori antibiotic resistance
В результате формирования устойчивости H. pylori к антибиотикам снизилась эффективность эрадикационной терапии. Выбор схем эрадикации базируется на данных о локальной резистентности к антибиотикам, прежде всего к кларитромицину. Предложен индивидуализированный подход эрадикации H. pylori, на основе определения устойчивости к антибиотикам до назначения терапии первой линии. ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ Провести сравнительную характеристику фенотипического и молекулярно-генетических методов выявления антибиотикорезистентности H. pylori, оценить их диагностическую чувствительность и специфичность. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ В исследование были включены 25 чистых культур H. pylori с установленной фенотипической чувствительностью и устойчивостью к антибактериальным препаратам. Устойчивость к кларитромицину и левофлоксацину определяли путем серийных разведений в катион-сбалансированном агаре Мюллера—Хинтон с добавлением овечьей крови в соответствии с рекомендациями Института клинических и лабораторных стандартов США (CLSI). Молекулярные маркеры устойчивости оценивали с помощью секвенирования по Сэнгеру и полимеразной цепной реакции в реальном времени (RT-PCR) со специфичными праймерами. Диагностическую чувствительность и специфичность молекулярных методов определяли в сравнении с результатами фенотипического метода. РЕЗУЛЬТАТЫ Установлено полное соответствие результатов фенотипических и молекулярных методов выявления устойчивости H. pylori к кларитромицину. При оценке резистентности к левофлоксацину было показано, что культуры, демонстрирующие фенотипическую устойчивость, также содержали мутации в гене gyrA, связанном с устойчивостью. Вместе с тем, некоторые культуры без фенотипической устойчивости имели характерные мутации гена gyrA. Чувствительность и специфичность молекулярных методов определения резистентности к кларитромицину составила 100%. Чувствительность выявления устойчивости к левофлоксацину составила 100%, специфичность — 78,57%. ВЫВОДЫ Исследование демонстрирует сильную связь между фенотипической и молекулярной резистентностью H. pylori, особенно к кларитромицину. Секвенирование по Сэнгеру и RT-PCR дали стабильные результаты, что подчеркивает надежность данного метода.