Yuri Oliver Ayala Sulca
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The organizations/institutes from the scholar's latest article
Research Subjects
Yuri Oliver Ayala Sulca has a total of 13 co-authors. Here are the top co-authors by number of shared publications:
- Angie Luna
Laboratorio de Genética de Poblaciones Molecular-Biología Evolutiva, Unidad de Genética, Departamento de Biología, Facultad de Ciencias, Pontificia Universidad Javeriana, Bogotá 110311, Colombia
1 shared publication - Armando Castellanos
Andean Bear Foundation, La Isla, Quito 170521, Ecuador
1 shared publication - Carlos Carrasco-Badajoz
Biodiversity and Geographic Information Systems Laboratory (BioSIG), Faculty of Mining, Geological and Civil Engineering, Universidad Nacional de San Cristóbal de Huamanga, Ayacucho 05000, Peru
1 shared publication - Carolina Rayme-Chalco
Biodiversity and Geographic Information Systems Laboratory (BioSIG), Faculty of Mining, Geological and Civil Engineering, Universidad Nacional de San Cristóbal de Huamanga, Ayacucho 05000, Peru
1 shared publication - François Catzeflis
Emeritus Researcher. CNRS and University of Montpellier. Institute of Evolutionary Sciences, University of Montpellier
1 shared publication - Héctor Aponte
Universidad Científica del Sur, Lima, Perú
1 shared publication
Latest Publications
- Open Access
Cryptic Genetic Diversity in Deer: The Evolution of the White-Tailed Deer (Cervidae, Artiodactyla) in the Neotropics
The systematics of white-tailed deer (Odocoileus virginianus) has been controversial. Some mammalogists consider the white-tailed deer to be a single species, whereas others consider it to consist of multiple species. To help resolve the controversy, we sequenced mitochondrial cytochrome B (mtCyt-b) in samples collected from 83 Neotropical white-tailed deer. Furthermore, we analyzed mitogenomes of samples collected from 19 white-tailed deer. There were five main results, as follows: (1) Phylogenetic analyses with the mtCyt-b dataset showed the existence of eight groups of O. virginianus, three in North and Central America and five in South America. It was hypothesized from different analyses that a Central American O. virginianus population generated the white-tailed deer populations in South America. (2) The haplotype temporal diversification within O. virginianus occurred during the Pleistocene. With the mitogenome dataset, it was dated to have occurred approximately 2.2 mya, using both Bayesian inference and haplotype networks. (3) All of these O. virginianus groups showed elevated levels of mitochondrial genetic diversity for the mtCyt-b dataset, with the exception of the Ecuadorian population (4) Some groups of O. virginianus yielded significant evidence of female population expansions with the mtCyt-b dataset. (5) Although the genetic heterogeneity among these O. virginianus groups was significant, the genetic distances were relatively small. Provisionally, the karyotypic differences between North American and Colombian specimens were very small; therefore, until further karyotypic studies demonstrate otherwise, we consider the existence of a single species of O. virginianus. Because mtDNA genomes have only one quarter of the effective number of autosomal nuclear genes, this generates relatively rapid coalescence times, which can inflate estimates of divergence among populations. Therefore, it is very important to soon sequence the nuclear genes for the different geographic assemblages of O. virginianus found.
Open AccessCryptic Genetic Diversity in Deer: The Evolution of the White-Tailed Deer (Cervidae, Artiodactyla) in the Neotropics
The systematics of white-tailed deer (Odocoileus virginianus) has been controversial. Some mammalogists consider the white-tailed deer to be a single species, whereas others consider it to consist of multiple species. To help resolve the controversy, we sequenced mitochondrial cytochrome B (mtCyt-b) in samples collected from 83 Neotropical white-tailed deer. Furthermore, we analyzed mitogenomes of samples collected from 19 white-tailed deer. There were five main results, as follows: (1) Phylogenetic analyses with the mtCyt-b dataset showed the existence of eight groups of O. virginianus, three in North and Central America and five in South America. It was hypothesized from different analyses that a Central American O. virginianus population generated the white-tailed deer populations in South America. (2) The haplotype temporal diversification within O. virginianus occurred during the Pleistocene. With the mitogenome dataset, it was dated to have occurred approximately 2.2 mya, using both Bayesian inference and haplotype networks. (3) All of these O. virginianus groups showed elevated levels of mitochondrial genetic diversity for the mtCyt-b dataset, with the exception of the Ecuadorian population (4) Some groups of O. virginianus yielded significant evidence of female population expansions with the mtCyt-b dataset. (5) Although the genetic heterogeneity among these O. virginianus groups was significant, the genetic distances were relatively small. Provisionally, the karyotypic differences between North American and Colombian specimens were very small; therefore, until further karyotypic studies demonstrate otherwise, we consider the existence of a single species of O. virginianus. Because mtDNA genomes have only one quarter of the effective number of autosomal nuclear genes, this generates relatively rapid coalescence times, which can inflate estimates of divergence among populations. Therefore, it is very important to soon sequence the nuclear genes for the different geographic assemblages of O. virginianus found.
- Open Access
- 22 October 2020
- Published by Universidad de Costa Rica in Revista de Biologia Tropical
- Vol. 68 (S2) , S116-S161
Macroinvertebrados acuáticos en arroyos asociados con bofedales altoandinos, Ayacucho Perú
Introducción: Los arroyos asociados a bofedales se hallan en ambientes donde las condiciones son extremas con temperaturas muy variables, baja presión atmosférica e intensa radiación solar. Sin embargo, existen ensamblajes de macroinvertebrados asociados a estos ambientes, cuya información es escasa. A escala global y regional, las características de los macroinvertebrados cambian con el aumento de la latitud y altitud (disminución de la riqueza y variación de la composición). A nivel local, también se puede agregar el efecto de las aguas ácidas y de elevada conductividad proveniente de manantiales que se unen a los arroyos, que generan heterogeneidad en la calidad de agua y consecuentemente en las características de los macroinvertebrados. Objetivo: Comparar la diversidad, composición y abundancia de macroinvertebrados y las características fisicoquímicas del agua de arroyos asociados a dos bofedales altoandinos, ubicados en el departamento de Ayacucho, Perú. Metodología: Se estudiaron once estaciones ubicados en arroyos de dos bofedales: 7 en Guitarrachayocc (G) de 43 ha (n = 28) y 4 en Pichccahuasi (P) de 28 ha (n = 8). Se empleó una red de Surber (0.3 mm de malla, área de muestreo de 1 200 cm2), para realizar muestreos mensuales de octubre de 2016 a abril de 2017. Análisis de componentes principales (PCA) y análisis de varianza multivariante no paramétrico (NP-MANOVA) se aplicaron para comparar las características del agua. Además, se utilizó un análisis de coordenadas principales (PCoA) y NP-MANOVA para comparar el ensamblaje. La prueba no paramétrica de Kruskal-Wallis (α = 0.05) se utilizó para comparar las abundancias absolutas de los taxa principales. Resultados: Las características del agua fueron heterogéneas, con pH de 3.2 (± 0.4) a 7.6 (± 0.1), conductividad de 168.9 (± 91) µS/cm a 1 117 (± 159.3) µS/cm; diferencias que fueron significativas (p < 0.05) al comparar las estaciones de muestreo, donde el agua de G6 presenta los mínimos valores de pH y los máximos de conductividad, al igual que cloruros. Se recolectaron un total de 8 126 individuos, distribuidos en 26 taxa de 20 familias, 11 órdenes y cinco clases. Los insectos fueron el grupo más diverso y abundante. A pesar a la cercanía de los arroyos de los bofedales, presentaron diferencias: en G, se registró 25 taxa, con dominancia de Macrelmis sp., Dicrotendipes sp., Claudioperla sp., Meridialaris sp. y en P, 9, con dominancia de Pedrowygomya sp., Hyalella sp. y Dicrotendipes sp. La densidad fue de 475 ind./m2 y de 31 ind./m2 para el bofedal G y P respectivamente, estos valores fueron estadísticamente diferentes (p < 0.05). El PCoA y el PCA confirmados por NP-MANOVA mostraron que G6 es diferente (p < 0.05) dentro de G porque recibe el aporte de agua de un manantial. Conclusiones: La riqueza, composición y densidad de los macroinvertebrados son diferentes en los arroyos según el bofedal al cual se halla asociado. La contribución de los manantiales a los arroyos genera cambios drásticos en la calidad del agua y los macroinvertebrados, determinando la formación de ensamblajes con diferente riqueza y estructura.
- 22 October 2020
- Published by Universidad de Costa Rica in Revista de Biologia Tropical
- Vol. 68 (S2) , S116-S161
Open AccessMacroinvertebrados acuáticos en arroyos asociados con bofedales altoandinos, Ayacucho Perú
Introducción: Los arroyos asociados a bofedales se hallan en ambientes donde las condiciones son extremas con temperaturas muy variables, baja presión atmosférica e intensa radiación solar. Sin embargo, existen ensamblajes de macroinvertebrados asociados a estos ambientes, cuya información es escasa. A escala global y regional, las características de los macroinvertebrados cambian con el aumento de la latitud y altitud (disminución de la riqueza y variación de la composición). A nivel local, también se puede agregar el efecto de las aguas ácidas y de elevada conductividad proveniente de manantiales que se unen a los arroyos, que generan heterogeneidad en la calidad de agua y consecuentemente en las características de los macroinvertebrados. Objetivo: Comparar la diversidad, composición y abundancia de macroinvertebrados y las características fisicoquímicas del agua de arroyos asociados a dos bofedales altoandinos, ubicados en el departamento de Ayacucho, Perú. Metodología: Se estudiaron once estaciones ubicados en arroyos de dos bofedales: 7 en Guitarrachayocc (G) de 43 ha (n = 28) y 4 en Pichccahuasi (P) de 28 ha (n = 8). Se empleó una red de Surber (0.3 mm de malla, área de muestreo de 1 200 cm2), para realizar muestreos mensuales de octubre de 2016 a abril de 2017. Análisis de componentes principales (PCA) y análisis de varianza multivariante no paramétrico (NP-MANOVA) se aplicaron para comparar las características del agua. Además, se utilizó un análisis de coordenadas principales (PCoA) y NP-MANOVA para comparar el ensamblaje. La prueba no paramétrica de Kruskal-Wallis (α = 0.05) se utilizó para comparar las abundancias absolutas de los taxa principales. Resultados: Las características del agua fueron heterogéneas, con pH de 3.2 (± 0.4) a 7.6 (± 0.1), conductividad de 168.9 (± 91) µS/cm a 1 117 (± 159.3) µS/cm; diferencias que fueron significativas (p < 0.05) al comparar las estaciones de muestreo, donde el agua de G6 presenta los mínimos valores de pH y los máximos de conductividad, al igual que cloruros. Se recolectaron un total de 8 126 individuos, distribuidos en 26 taxa de 20 familias, 11 órdenes y cinco clases. Los insectos fueron el grupo más diverso y abundante. A pesar a la cercanía de los arroyos de los bofedales, presentaron diferencias: en G, se registró 25 taxa, con dominancia de Macrelmis sp., Dicrotendipes sp., Claudioperla sp., Meridialaris sp. y en P, 9, con dominancia de Pedrowygomya sp., Hyalella sp. y Dicrotendipes sp. La densidad fue de 475 ind./m2 y de 31 ind./m2 para el bofedal G y P respectivamente, estos valores fueron estadísticamente diferentes (p < 0.05). El PCoA y el PCA confirmados por NP-MANOVA mostraron que G6 es diferente (p < 0.05) dentro de G porque recibe el aporte de agua de un manantial. Conclusiones: La riqueza, composición y densidad de los macroinvertebrados son diferentes en los arroyos según el bofedal al cual se halla asociado. La contribución de los manantiales a los arroyos genera cambios drásticos en la calidad del agua y los macroinvertebrados, determinando la formación de ensamblajes con diferente riqueza y estructura.