Objetiva-se analisar as Boas Práticas em Unidades de Alimentação e Nutrição Escolar bem como os desafios e potencialidades para sua operacionalização na perspectiva de nutricionistas e merendeiros de um Município do Rio de Janeiro. Realizou-se pesquisa qualiquantitativa por meio da aplicação de Lista de Verificação das Boas Práticas da Alimentação Escolar nas Unidades, bem como entrevistas com nutricionistas e rodas de conversa com merendeiras. Foram identificadas Unidades de Alimentação e Nutrição Escolar com risco sanitário alto, regular e baixo assim como desafios e potencialidades para a execução das Boas Práticas entre os temas gestão municipal do programa, gestão escolar e processos de trabalho dos merendeiros e dos nutricionistas. Os resultados indicaram a necessidade de desenvolvimento de ações articuladas entre atores e setores envolvidos com o Programa de Alimentação Escolar no Município com vistas à sua qualificação.