Lucas Moraes dos Santos

A sexta edição da Revista BIOINFO, organizada em colaboração com o Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática da UFMG, reúne 31 artigos, além deste editorial. Os trabalhos publicados nesta edição foram apresentados no evento “Bioinformática 2035: Desafios e Formação de Talentos para a Próxima Década”. Este editorial apresenta uma síntese do evento, destacando seus principais temas, discussões e conclusões.

O aprendizado multimodal tem se consolidado como abordagem promissora para lidar com a heterogeneidade e a complexidade dos dados biomédicos, especialmente em doenças como o câncer. Ao integrar descritores de múltiplas modalidades, esses modelos aprendem representações latentes mais expressivas e robustas a mudanças na distribuição dos dados, inclusive em cenários com poucos rótulos. Neste trabalho, discutimos fundamentos de aprendizado de representação multimodal e o papel de arquiteturas modernas, como Transformers e redes neurais de grafos, na modelagem de dependências de longo alcance e estruturas relacionais. Em particular, comparamos duas técnicas centrais de representação: (i) representação conjunta e (ii) representação coordenada. Por fim, destacamos aplicações recentes e desafios em interpretabilidade e robustez.

Este livro compila os artigos publicados na Revista BIOINFO Vol. 5 (2025). Todos os direitos autorais pertencem aos autores de cada respectivo artigo. Todavia, os autores concordam em compartilhar gratuitamente o conteúdo deste livro e incentivam sua livre distribuição (desde que os autores dos respectivos capítulos sejam corretamente citados e/ou que as leis de uso justo sejam respeitadas). Este livro está compartilhado sob a licença Creative Commons Atribuição 4.0 Internacional - Não comercial (CC BY-NC 4.0). Você pode utilizar qualquer conteúdo aqui apresentado, desde que cite: Moura Junior, Adenilson Arcanjo de (org.) et al. BIOINFO #05 - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 5. Ed. Vol. 5. ISBN: 978-65-84391-01-7. Lagoa Santa: Alfahelix, 2025. doi: 10.51780/978-65-84391-01-7

As mutações gênicas são alterações essenciais para a evolução e o funcionamento biológico, mas podem causar o descontrole do ciclo celular e levar à formação de tumores, resultando em câncer. A diferenciação entre mutações drivers e passengers é dificultada pela heterogeneidade das mutações cancerígenas. Para superar essas limitações, pode-se usar a similaridade (homologia) entre as sequências para comparar as interações estabelecidas em um conjunto de sequências homólogas, oferecendo indícios sobre como uma mutação pontual poderia alterar a rede de interações de uma proteína. Esse projeto objetiva usar ferramentas computacionais para auxiliar nesse processo de análise, obtendo informações sobre a estrutura das cadeias homólogas, as biomoléculas com as quais interagem e o sítio de ligação dessas interações, além de contribuir para o entendimento de como as mutações estudadas conferem vantagens evolutivas às células e facilitam sua proliferação.

In recent years, artificial intelligence (AI) techniques have revolutionized research in the life sciences. This became possible thanks to the emergence of new methods and technologies that allowed the generation of high quality and large-scale biological data. Allied to this, bioinformatics techniques have allowed the modeling and resolution of biological problems so that the applications of machine learning models have raised new perspectives. In this paper, we will address the impacts of AI on the life sciences, with particular emphasis on those mediated by bioinformatics, advances in AI models and algorithms, and the consequences for research in the life sciences.

O aprendizado de linguagens de programação é de extrema importância para o desenvolvimento web. Existem diversas linguagens de programação usadas em diferentes aspectos do desenvolvimento de aplicações web, e cada uma delas possui sua própria importância. Neste livro, abordaremos os passos iniciais para trabalhar com HTML, CSS, PHP e JavaScript, além do Framework CodeIgniter. Com HTML e CSS, você pode criar layouts e estilos de página que são exibidos em todos os dispositivos, desde desktops até dispositivos móveis. O PHP é uma linguagem de programação de back-end que permite criar aplicativos e scripts que podem interagir com bancos de dados, enviar e-mails e muito mais. O JavaScript é uma linguagem de programação de front-end que permite criar interações em tempo real com o usuário, como animações, validação de formulários e muito mais. Compreender essas linguagens permite aos desenvolvedores criar sites dinâmicos, interativos e personalizados que atendam às necessidades dos usuários. Além disso, o conhecimento de linguagens de programação pode levar a oportunidades de carreira em áreas relacionadas ao desenvolvimento de aplicações web.O conteúdo abordado neste livro foi baseado no conteúdo do LBS Tech, um conjunto de palestras e aulas voltadas para o ensino das tecnologias utilizadas pelo grupo de pesquisa do Laboratório de Bioinformática e Sistemas da UFMG (Universidade Federal de Minas Gerais). Cada módulo terá, junto a ele, o link do vídeo da aula correspondente, e o seu uso em conjunto com este livro permitirá um aprendizado mais completo. Bons estudos!

Bem-vindo ao mundo da programação com Python! Este livro foi cuidadosamente projetado para fornecer uma introdução abrangente e prática ao Python. Ele foi baseado no conteúdo do LBS Tech, um conjunto de palestras e aulas voltadas para o ensino das tecnologias utilizadas pelo grupo de pesquisa do Laboratório de Bioinformática e Sistemas da UFMG (Universidade Federal de Minas Gerais). Cada módulo terá, junto a ele, o link do vídeo da aula correspondente, e o seu uso junto ao livro permitirá um aprendizado mais completo. Ao longo deste livro, você irá aprender os fundamentos da programação em Python, incluindo a criação e manipulação de variáveis, estruturas condicionais e de repetição, funções e trabalhar com arquivos. Além disso, você irá explorar diversas opções de bibliotecas disponíveis e como utilizá-las. Python é uma das linguagens de programação mais populares e utilizadas atualmente, e pode ser aplicada desde a criação de jogos simples até o processamento de grandes conjuntos de dados. Por exemplo, a ciência de dados é um campo que tem crescido rapidamente nos últimos anos, e o Python é frequentemente a linguagem de escolha para análise e visualização de dados. Ao concluir este livro, você terá aprendido o básico e intermediário da linguagem, desenvolvendo habilidades necessárias para pensar em soluções para diversos problemas usando o Python. Esperamos que esteja animado para começar sua jornada de aprendizado e que você aproveite os estudos e possa aplicar seus novos conhecimentos em projetos incríveis. Bons estudos!